El segon volum de la sèrie recull els testimonis epigràfics del vell comtat emporità, situat al sud del de Peralada i, en aquest cas, molts dÆaquests també són inèdits. Seguint lÆestructura del primer comtat, es fa una introducció i un estudi per oferir, seguidament, el catàleg de cadascun dÆaquests textos.
La doble capitalitat del comtat, primer a Sant Martí dÆEmpúries, amb el seu passat grecoromà i lÆantic bisbat visigòtic, traslladada posteriorment a Castelló dÆEmpúries, amb la seva catedral gòtica, aporta un gruix molt important del cos epigràfic, que sempre segueix una ordenació cronològica.
Els grans monestirs no tenen, en canvi, lÆentitat del volum anterior, i es limiten als de Sant Miquel de Fluvià i Santa Maria dÆUllà.
Finalment, un tercer conjunt agrupa les inscripcions del seu territori o pagus, en aquest cas, ordenats per ordre alfabètic dels diversos municipis actuals.